利用微生物对不同碳源代谢率的差异，针对每一类微生物筛选95种不同碳源，配合四唑类显色物质（如TTC、TV），固定于96孔板上（A1孔为阴性对照），接种菌悬液后培养一定时间，通过检测微生物细胞利用不同碳源进行新陈代谢过程中产生的氧化还原酶与显色物质发生反应而导致的颜色变化（吸光度）以及由于微生物生长造成的浊度差异（浊度），与标准菌株数据库进行比对，即可得出最终鉴定结果。鉴定细菌时，全部基于呼吸代谢导致的显色反应原理；鉴定酵母时，A-C行基于显色反应原理，D-H行基于浊度差异原理；鉴定真菌时，系统自动为95种碳源测定两套数据，即显色反应和浊度。

Biolog鉴定系统可鉴定包括细菌、酵母和真菌在内约2000种微生物，便于各领域的微生物实验室用于对微生物的鉴定；适用于生态研究领域，可进行微生物鉴定、微生物代谢研究、微生物群落分析及新产品开发与质量控制。